Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms