Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
SCAPERQ9BY12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SCAPERQ9BY12 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SCAPERQ9BY12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms