Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC46A2Q9BY10 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC46A2Q9BY10 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms