Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNG6Q9BXT2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNG6Q9BXT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms