Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FDXACB1Q9BRP7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms