Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
FYCO1Q9BQS8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FYCO1Q9BQS8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms