Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPIN3Q9BQK8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LPIN3Q9BQK8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms