Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3Q99687 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MEIS3Q99687 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms