Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRBNQ96SW2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRBNQ96SW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms