Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms