Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT2BQ96GJ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms