Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms