Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC10A4Q96EP9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC10A4Q96EP9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms