Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC127Q96BQ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC127Q96BQ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms