Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCAMP4Q969E2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCAMP4Q969E2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms