Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF3Q92576 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms