Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CSRNP3Q8WYN3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSRNP3Q8WYN3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms