Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSPC1Q8WXF1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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