Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
COPS9Q8WXC6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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