Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms