Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms