Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms