Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FSIP1Q8NA03 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms