Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms