Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PLD3Q8IV08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PLD3Q8IV08 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms