Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP6Q7Z6E9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms