Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3BQ7Z3V4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE3BQ7Z3V4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms