Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCO3Q6UWJ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms