Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC171Q6TFL3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC171Q6TFL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms