Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOA5Q6Q788 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOA5Q6Q788 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms