Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL35Q6PF15 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms