Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF544Q6NX49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms