Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABLIM2Q6H8Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ABLIM2Q6H8Q1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms