Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPECC1LQ69YQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms