Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCERG1LQ5VWI1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCERG1LQ5VWI1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms