Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf53Q5VUE5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms