Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOGA3Q5TF21 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOGA3Q5TF21 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms