Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PHYHD1Q5SRE7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms