Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COLEC12Q5KU26 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms