Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDCCQ504Y2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms