Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP100Q494V2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP100Q494V2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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