Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms