Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TWISTNBQ3B726 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TWISTNBQ3B726 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TWISTNBQ3B726 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms