Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms