Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDO1Q16878 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDO1Q16878 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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