Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTN1Q16799 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTN1Q16799 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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