Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B3Q16720 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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