Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRNP35Q16560 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP35Q16560 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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