Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMA4Q16363 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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