Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMC2Q13753 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC2Q13753 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC2Q13753 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC2Q13753 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMC2Q13753 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms